Он создан под руководством губернатора региона.
Из силового блока в штаб вошли глава Росгвардии области Раис Айбатов, начальник управления МЧС Андрей Андреев, глава УМВД Демьян Лаптев и военком Сергей Егерь. Пост заместителя главы штаба получил начальник областного управления ФСБ Олег Трофимов.
Второго заместителя назначили формально из гражданских чиновников — это замгубернатора по безопасности, экс-офицер ФСБ и Госнаркоконтроля Игорь Толстоносов. Из сотрудников администрации места в штабе получили также вице-губернаторы Андрей Антонов, Андрей Кнорр, Алена Левко, Людмила Огородова, Анатолий Рожков, Николай Руппель и Александр Феденев.
Также среди членов штаба — главный федеральный инспектор области Владимир Сирчук и председатель комитета обладминистрации по мобилизационной подготовке Андрей Нецветаев.
В соответствии с указом президента РФ Владимира Путина оперштабы создаются во всех российских регионах. Томская область попала в число регионов четвертого уровня, в которых введен режим базовой готовности: в области усиливается охрана общественного порядка и важных объектов.